汞毒性非常的强大，每一状态都有毒性。
汞蒸气能够因吸入后进入脑部，造成脑部受损。无机汞盐能经由肠道吸收，进而进入肾并伤害肾脏。有机汞的毒性更强。在部分地区，无机汞被当成泻药使用。
水俣病就是有机汞造成事故的例证。经由生物放大作用后，有机汞（甲基汞）被人大量的摄入体内。造成神经性的损伤，记忆丧失，情绪不稳，失去肌肉协调性。孕妇则有诞下畸形儿的案例。
汞会被传入脑中，并和脑中的含硫蛋白交互作用，例如神经部分的酶。甲基汞有脂溶性，使得其更容易进入神经系统。对于胎儿而言，会进入胚胎和胚胎的神经系统，妨碍胎儿的头脑和脊髓发育。
天然汞（液态汞）会被吸入，进入脑部组织则损坏脑部造成头疼，同时可能破坏牙龈和牙齿。但是液态汞被胃部吸收的话危害反而不会太大。只有极少会被吸收入血液中。另外的无机汞盐，会进入血液并与含硫的化合物如蛋白质结合；虽然肾能够解除部分毒性，但是他们会因递降分解，送入细泡内，这时造成严重的破坏。（无机汞不对脑部造成影响，因为它们不溶于油脂。）
所有形态的汞都会和硫交互作用，这在像酶这类的蛋白质作用中有着重要的地位。Na,K-ATPase钠离子钾离子腺苷三磷酸酶，被认为是甲基汞的特定目标之一。钾离子和钠离子对人体神经功能极为重要。严重中毒者会被破坏脑部神经细泡。
三种汞在人体内分配不同，所以效应也不同。
